Študent ovláda princípy najpoužívanejších metód v metabolomike – NMR spektroskopiu, vrátane in vivo, a hmotnostnú spektrometriu spojenú s chromatografickou separáciou, vie, ako ich použiť pri štúdiu endo- a exo-metabolómu s ich výhodami a nevýhodami. Absolvent vie tiež vyhodnotiť dáta multivariantnými štatistickými metódami.

Úvod do metabolomiky. NMR spektroskopia - princípy, základné parametre, NMR spektrometer. Príprava vzorky a meranie NMR spektier. Určovanie štruktúry a metódy kvantifikácie metabolitov.
In vivo MRS. Zvieracie modely, lokalizácia. Pokročilejšie MRS metódy.
GC/MS a LC/MS. Princípy separácie. Príprava vzorky. Derivatizácia. Spôsoby ionizácie a druhy detektorov. Vyhodnocovanie
Štatistické vyhodnotenie metabolomických dát – jedno a viacrozmerná analýza, príprava dát, PCA, PLS-DA

Priama výučba: 26 h
prednášky 23 h
ukážka meraní a exkurzia 3 h

Nepriama výučba: 24 h
príprava na prednášky 12 h
príprava na testy 12 h

Písomné testy zo 4 hlavných tematických častí prispievajú k výslednej známke - Metabolomika a NMR spektroskopia (40 %), in vivo MRS (15 %), chromatografia a hmotnostná spektrometria (15 %), štatistická analýza (30 %). Hodnotenie podľa klasifikačnej stupnice STU.